De carácter autónomo e independiente de todo otro Poder del Estado, el Consejo de la Magistratura de la provincia de Misiones tiene como función proponer al Poder Ejecutivo, para su designación, a los jueces, fiscales y defensores del Poder Judicial. 

El Consejo fue creado en el año 2000 por Ley IV – Nº 32 y la integración de sus autoridades titulares está compuesta por:

• un (1) Ministro del Superior Tribunal de Justicia;
• un (1) representante del Poder Ejecutivo;
• dos (2) abogados;
• dos (2) diputados;
• un (1) consejero designado entre los magistrados inferiores y funcionarios del Poder Judicial.

Cabe destacar que cada cargo cuenta con su respectivo suplente y dichas autoridades se renuevan cada dos años.