El 30 de junio de 1810, a través de un Decreto de la Primera Junta de Gobierno y redactado por Mariano Moreno, Martín Jacobo Thompson es nombrado como primer Capitán de Puerto de las Provincias Unidas del Río de la Plata, quien se desempeñaba como alférez de fragata de la Armada Real Española, siendo nombrado en 1815 Coronel de Marina.

La Prefectura es la Autoridad Marítima de nuestro país, de acuerdo a lo que establece la Ley General 18.398, la Ley de la Navegación 20.094, como así también la legislación, que de manera nutrida define el amplio perfil de las competencias que tiene la Autoridad.

En la actualidad, la Fuerza se encuentra bajo la órbita del Ministerio de Seguridad de la Nación y entre sus múltiples tareas tiene a su resguardo la seguridad de todas las vías navegables interiores, además del Mar Argentino, siendo también auxiliar de la Justicia, de los derechos y las obligaciones que las leyes argentinas demandan.

Parte de su historia indica que en el año 1945 comenzó la construcción de la sede de la Prefectura Naval Argentina, en las calles Cangallo (hoy Teniente General Perón) y su intersección con la Av. Eduardo Madero, en lo que en la actualidad conocemos como Ciudad Autónoma de Buenos Aires. Construcción que fue finalizada en 1949, pero sin el total de las instalaciones necesarias. Por ello su inauguración definitiva tuvo que esperar 30 años más.

Su presencia en cada río, en el Mar Argentino, la presencia ciudadana en calles de nuestro país, hacen valorable la tarea de sus efectivos, quienes a diario, como otros hombres de otras Fuerzas, arriesgan su vida combatiendo delitos o rescatando un tripulante en altamar por mencionar solo algunas de sus tareas.

Esta fuerza tiene como labor proteger la salida y entrada en aguas nacionales, registro de buques y control de condiciones de seguridad de acuerdo a las leyes del país y los acuerdos internacionales.

Se trata de una autoridad marítima que garantiza la navegación y las vidas humanas, así como los derechos y las obligaciones de aquellos cuyo oficio está relacionado con las vías fluviales y las actividades portuarias, aplicando las leyes pertinentes.

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